Elevate quantità di spore nell'aria al chiuso rispetto alle condizioni esterne sono fortemente indicative della crescita di muffe indoor. La determinazione del conteggio delle spore aerodisperse viene effettuata mediante un campione d'aria, nel quale viene azionata una pompa specializzata con una portata di flusso noto per un periodo di tempo noto. I campioni d'aria conduttivi alla metodologia scientifica devono essere prelevati dall'area interessata, da un'area di controllo e dall'esterno.
La pompa del campionatore d'aria aspira aria e deposita particelle aerodisperse al microscopio su un mezzo di coltura. Il terreno è coltivato in laboratorio e il genere e le specie fungine sono determinati dall'osservazione visiva al microscopio. I risultati di laboratorio quantificano anche la crescita dei funghi mediante un conteggio delle spore per il confronto tra i campioni. Il tempo di funzionamento della pompa è stato registrato e quando viene moltiplicato per il tempo di funzionamento si ottiene un volume specifico di aria ottenuto. Anche se viene effettivamente analizzato un piccolo volume di aria, le comuni tecniche di reporting di laboratorio estrapolano i dati del conteggio delle spore per equiparare la quantità di spore che sarebbero presenti in un metro cubo di aria